Методы численного моделирования молекулярных систем, такие как молекулярная динамика, рассматривают эти системы как механические (что-то вроде набора шариков на пружинках). Однако, в отличие от механических систем, для молекулярных существует понятие температура. Вещество не…
CUDA всем хороша, пока под рукой есть видеокарта от Nvidia. Но что делать, когда на любимом ноутбуке нет Nvidia видеокарты? Или нужно вести разработку в виртуальной машине? Я постараюсь рассмотреть в этой статье такое решение, как фреймворк rCUDA (Remote CUDA), который поможет, когда Nvidia…
CUDA А зачем? Пожалуй, сразу отвечу, для чего было придумано такое решение. Когда мы держали проект в виде OpenSource, то пытались сохранить политику «скачал код, собрал одной кнопкой», но с момента использования технологии CUDA ситуация стала сложнее… Большая часть комьюнити кричала, что ничего не собирается и устанавливать сторонние SDK они не хотят. Читать дальше →
Цель данной статьи – поднять вопросы распараллеливания кода программы для численного моделирования методом молекулярной динамики (МД) с помощью технологии CUDA. Зачем это вообще нужно, ведь уже существуют программные пакеты по МД, работающие в том числе и на CUDA? Дело в том, что я…